新疆交通运输“十二五”规划的总体思路是：贯穿一条主线，突出两大工程，实现五大突破。贯穿一条主线：以率先发展、科学跨越为主线。突出两大工程：突出“57712”工程和农村富民畅通工程。“57712”工程是指：构筑“五横七纵”高速、高等级公路网，建设七大国家级公路运输枢纽，建成四条东联内地和八条西出国际共计十二条通道。
“5”横分别是：华东－星星峡－乌鲁木齐－霍尔果斯口岸高速公路（区内里程1431公里）；华北－明水－克拉玛依－巴克图口岸高速公路（区内里程1520公里）；乌鲁木齐－喀什－红其拉甫口岸高速、高等级公路（1760公里）；西南－西宁－依吞布拉克－和田－喀什－伊尔克斯坦口岸高速公路（区内里程1895公里）；伊宁－托克逊－哈密－西煤东运煤炭基地高等级公路（1254公里）。
“7”纵分别是：阿勒泰－乌鲁木齐－依吞布拉克－西宁－西南高速公路（区内里程1442公里）；阿勒泰－奎屯－库车－和田高速、高等级公路（1733公里）；喀纳斯口岸－阿拉山口－阿克苏－英吉沙高等级公路（2106公里）；阿黑土别克口岸－阿勒泰－木垒－鄯善－西煤东运煤炭基地高等级公路（1210公里）；老爷庙口岸－哈密－若羌高等级公路（883公里）；轮台－民丰－红土达坂高等级公路（区内里程1146公里）；阿克苏－图木舒克－叶城－西藏高速、高等级公路（区内里程1434公里）。
“7”大国家级公路运输枢纽包括：乌鲁木齐、伊宁（霍尔果斯）、喀什、哈密、库尔勒、石河子、奎屯。
“12”条东联西出通道包括：
4条东联出疆通道：明水（甘肃）、星星峡（甘肃）、依吞布拉克（青海）、界山大坂（西藏）。
8条西出国际通道：霍尔果斯口岸、阿拉山口口岸、巴克图口岸、伊尔克什坦口岸、红其拉甫口岸、吐尔尕特口岸、吉木乃口岸、塔克什肯口岸。
农村富民畅通工程：以推进网络化、黑色化为主，实现千万人便捷出行的农村公路网。
实现五大突破：即交通运输基础设施建设取得重大突破，到2015年提前5年实现骨架公路高速化、干线路网高等级化、国边防公路等级化，通乡达村公路黑色化；道路运输发展取得重大突破，实现城市公交便捷化、城乡客运一体化、物流服务高效化、国际运输便利化；公路养护和应急保障能力取得重大突破；文化引领、科技进步、人才保障等软实力建设取得重大突破；综合交通运输体系规划建设取得重大突破。